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Bacterial diversity of soil under eucalyptus assessed by 16S rDNA sequencing analysis PAB
Silveira,Érico Leandro da; Pereira,Rodrigo Matheus; Scaquitto,Denilson César; Pedrinho,Eliamar Aparecida Nascimbém; Val-Moraes,Silvana Pómpeia; Wickert,Ester; Carareto-Alves,Lúcia Maria; Lemos,Eliana Gertrudes de Macedo.
Studies on the impact of Eucalyptus spp. on Brazilian soils have focused on soil chemical properties and isolating interesting microbial organisms. Few studies have focused on microbial diversity and ecology in Brazil due to limited coverage of traditional cultivation and isolation methods. Molecular microbial ecology methods based on PCR amplified 16S rDNA have enriched the knowledge of soils microbial biodiversity. The objective of this work was to compare and estimate the bacterial diversity of sympatric communities within soils from two areas, a native forest (NFA) and an eucalyptus arboretum (EAA). PCR primers, whose target soil metagenomic 16S rDNA were used to amplify soil DNA, were cloned using pGEM-T and sequenced to determine bacterial diversity....
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Genetic diversity; Metagenomic; Microbial communities.
Ano: 2006 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-204X2006001000008
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Bactérias produtoras de auxinas isoladas de raízes de Cattleya walkeriana, orquídea Brasileira ameaçada de extinção, e sua função na aclimatização Rev. Bras. Ciênc. Solo
Galdiano Júnior,Renato Fernandes; Pedrinho,Eliamar Aparecida Nascimbém; Castellane,Tereza Cristina Luque; Lemos,Eliana Gertrudes de Macedo.
Bactérias produtoras de auxinas habitam raízes de orquídeas e podem trazer benefícios para a planta hospedeira. Plantas dessa família são multiplicadas em condições assimbióticas in vitro e pouco se conhece sobre a função desses microrganismos para a aclimatização ex vitro. Quatro rizobactérias isoladas da espécie Cattleya walkeriana foram avaliadas por sua capacidade de promoção do crescimento e sobrevivência de plântulas germinadas in vitro durante a aclimatização. Essas rizobactérias foram identificadas como Bacillus, Burkholderia, Enterobacter e Curtobacterium, com base no sequenciamento do gene 16S rRNA. A presença de compostos indólicos no sobrenadante filtrado de culturas líquidas foi quantificada por ensaios colorimétricos e cromatografia líquida...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Rizobactérias promotoras do crescimento de plantas; Compostos indólicos; Orchidaceae.
Ano: 2011 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-06832011000300008
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Identificação e avaliação de rizobactérias isoladas de raízes de milho Bragantia
Pedrinho,Eliamar Aparecida Nascimbém; Galdiano Júnior,Renato Fernandes; Campanharo,João Carlos; Alves,Lúcia Maria Carareto; Lemos,Eliana Gertrudes de Macedo.
Estudos sobre a atividade microbiológica que ocorre na rizosfera de diversos vegetais levaram ao descobrimento de grupos de microrganismos importantes para o desenvolvimento vegetal. Dentre eles estão as rizobactérias que são capazes de colonizar as raízes, estimulando-a diretamente ou beneficiando o crescimento e o desenvolvimento de diversas plantas. Estas bactérias são chamadas Rizobactérias Promotoras de Crescimento em Plantas (RPCP). Este trabalho teve o objetivo de isolar, identificar, testar a capacidade da solubilização de fosfato e a produção de ácido indol acético (AIA) de bactérias que habitam a rizosfera de plantas de milho. A análise parcial do gene 16S rRNA dos 58 isolados possibilitou a identificação dos gêneros, Bacillus, Burkholderia e...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: RPCP; Ácido indol acético; Solubilização de fosfato; Sphingomonas spp.
Ano: 2010 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0006-87052010000400017
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Molecular characterization of bacterial populations of different soils BJM
Pereira,Rodrigo Matheus; Silveira,Érico Leandro da; Scaquitto,Denilson César; Pedrinho,Eliamar Aparecida Nascimbém; Val-Moraes,Silvana Pompéia; Wickert,Ester; Carareto-Alves,Lúcia Maria; Lemos,Eliana Gertrudes de Macedo.
Until recently, few studies were carried out in Brazil about diversity of bacterial soil communities. Aiming to characterize the bacterial population in the soil through 16S rRNA analysis, two types of soil have been analyzed: one of them characterized by intensive use where tomato, beans and corn were cultivated (CS); the other analyzed soil was under forest (FS), unchanged by man; both located in Guaíra, São Paulo State, Brazil. Using specific primers, 16S rRNA genes from metagenomic DNA in both soils were amplified by PCR, amplicons were cloned and 139 clones from two libraries were partially sequenced. The use of 16S rRNA analysis allowed identification of several bacterial populations in the soil belonging to the following phyla: Acidobacteria,...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Metagenome; Microbial diversity; 16S rRNA.
Ano: 2006 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1517-83822006000400007
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